Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LLGL2Q6P1M3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms