Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CARMIL2Q6F5E8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms