Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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