Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ANKRD39Q53RE8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms