Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM259Q4ZIN3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms