Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms