Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTXN3Q4LDR2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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