Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms