Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms