Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL24A1Q17RW2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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COL24A1Q17RW2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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