Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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