Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF1AQ16665 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms