Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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