Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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