Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDCD1Q15116 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDCD1Q15116 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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