Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CDK5R1Q15078 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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