Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms