Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNB1Q14721 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms