Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ALCAMQ13740 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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