Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FHL3Q13643 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms