Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PEX6Q13608 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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