Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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