Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RLFQ13129 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RLFQ13129 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RLFQ13129 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RLFQ13129 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms