Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LMAN2Q12907 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LMAN2Q12907 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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