Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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