Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms