Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNB2Q08289 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 496.3 ms