Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SRSF4Q08170 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms