Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TFF3Q07654 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TFF3Q07654 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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