Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTDSPL2Q05D32 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms