Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC6Q03468 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms