Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK17Q00537 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK17Q00537 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms