Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms