Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UFM1P61960 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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