Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFRD-1P60508 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms