Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A2P55011 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms