Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA8P53708 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms