Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPAP53621 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPAP53621 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPAP53621 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPAP53621 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms