Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PAPOLAP51003 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PAPOLAP51003 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms