Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK1EP49674 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms