Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCLMP48507 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms