Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms