Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms