Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMPOP42166 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMPOP42166 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMPOP42166 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms