Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR1BP42025 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms