Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZEB1P37275 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZEB1P37275 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms