Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMGCLP35914 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms