Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL9P32969 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms