Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA3P32297 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms