Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1P31415 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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CASQ1P31415 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASQ1P31415 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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